More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3829 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  100 
 
 
464 aa  952    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2816  sugar transferase  55.97 
 
 
463 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.96 
 
 
473 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.49 
 
 
473 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  42.49 
 
 
473 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.7 
 
 
472 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.19 
 
 
496 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  39.71 
 
 
464 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.12 
 
 
464 aa  294  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.68 
 
 
472 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.55 
 
 
471 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  42.86 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.12 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  51.26 
 
 
468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  42.29 
 
 
464 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.68 
 
 
477 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.91 
 
 
464 aa  279  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.57 
 
 
464 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.73 
 
 
464 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  45.25 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.25 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  45.25 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.25 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.25 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.25 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.47 
 
 
454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  40 
 
 
457 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.41 
 
 
516 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.53 
 
 
460 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.94 
 
 
464 aa  272  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  37.53 
 
 
460 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  38.57 
 
 
512 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.39 
 
 
459 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.29 
 
 
460 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  37.29 
 
 
460 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.05 
 
 
445 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.48 
 
 
512 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50 
 
 
471 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.72 
 
 
460 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.98 
 
 
465 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.93 
 
 
461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.97 
 
 
464 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.97 
 
 
464 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.31 
 
 
468 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.97 
 
 
464 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.97 
 
 
464 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.67 
 
 
346 aa  266  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.97 
 
 
464 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.83 
 
 
460 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.88 
 
 
465 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  38.79 
 
 
466 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.01 
 
 
457 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.86 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  38.01 
 
 
478 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  38.01 
 
 
478 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.06 
 
 
461 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  39.52 
 
 
466 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  38.93 
 
 
472 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  38 
 
 
461 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.68 
 
 
467 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  37.98 
 
 
484 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  35.02 
 
 
469 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.42 
 
 
469 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  45.82 
 
 
484 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.03 
 
 
465 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  36.8 
 
 
465 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.23 
 
 
468 aa  256  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.04 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  36.98 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.53 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  37.3 
 
 
477 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  43.2 
 
 
477 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.3 
 
 
457 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.87 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  44.52 
 
 
469 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.71 
 
 
466 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.97 
 
 
506 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  38.9 
 
 
460 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  38.9 
 
 
460 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.37 
 
 
393 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.9 
 
 
460 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.9 
 
 
460 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.9 
 
 
461 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  38.9 
 
 
460 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  38.9 
 
 
460 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.13 
 
 
505 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  40.79 
 
 
454 aa  249  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  35.95 
 
 
468 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.67 
 
 
458 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1154  sugar transferase  36.83 
 
 
510 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  36.5 
 
 
471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.79 
 
 
506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.91 
 
 
482 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  41.14 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  36.38 
 
 
484 aa  245  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  41.25 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.03 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  40.84 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.77 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.77 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>