More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05207 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  100 
 
 
466 aa  961    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  83.48 
 
 
466 aa  826    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  55.34 
 
 
469 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  55.36 
 
 
465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  53.98 
 
 
484 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.62 
 
 
466 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48.78 
 
 
468 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  48.94 
 
 
464 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.14 
 
 
464 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  46.14 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  46.14 
 
 
464 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  46.14 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  46.14 
 
 
464 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  46.14 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  46.14 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.92 
 
 
464 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.87 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.11 
 
 
468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  47.06 
 
 
466 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.54 
 
 
465 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  49.29 
 
 
464 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  49.29 
 
 
464 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  49.29 
 
 
464 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  51 
 
 
464 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  49.29 
 
 
464 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  49.06 
 
 
464 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  56.11 
 
 
474 aa  392  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  46.17 
 
 
469 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  46.11 
 
 
464 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46.25 
 
 
469 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.35 
 
 
496 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.9 
 
 
472 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.6 
 
 
464 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  43.74 
 
 
461 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  43.13 
 
 
454 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.05 
 
 
454 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.25 
 
 
460 aa  346  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  38.85 
 
 
464 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.68 
 
 
471 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1875  sugar transferase  47.15 
 
 
477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  43.88 
 
 
456 aa  332  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.23 
 
 
393 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.76 
 
 
465 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  43.24 
 
 
472 aa  329  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.19 
 
 
460 aa  322  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2680  sugar transferase  45.83 
 
 
474 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0796334  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.81 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.33 
 
 
346 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.49 
 
 
459 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.78 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  39.39 
 
 
468 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.11 
 
 
445 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  39.75 
 
 
457 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  36.38 
 
 
478 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  36.38 
 
 
478 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.6 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.44 
 
 
516 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.31 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.12 
 
 
477 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.32 
 
 
471 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.28 
 
 
460 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  37.28 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.28 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.98 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  35.7 
 
 
512 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.7 
 
 
512 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  36.98 
 
 
465 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.95 
 
 
461 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.11 
 
 
457 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  33.97 
 
 
461 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  39.11 
 
 
477 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  40.9 
 
 
477 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.46 
 
 
461 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.8 
 
 
506 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  36.41 
 
 
460 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.89 
 
 
505 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  37.29 
 
 
506 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  34.9 
 
 
460 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  34.9 
 
 
460 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  34.9 
 
 
460 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.9 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.9 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.9 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.9 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  33.99 
 
 
471 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.6 
 
 
471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.16 
 
 
458 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.43 
 
 
461 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.06 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.34 
 
 
471 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  33.55 
 
 
459 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  36.7 
 
 
484 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  38.97 
 
 
478 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0851  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.55 
 
 
547 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985925  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.59 
 
 
461 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2816  sugar transferase  37.89 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  34.5 
 
 
459 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.53 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  36.07 
 
 
464 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.35 
 
 
518 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>