More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1065 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  100 
 
 
464 aa  941    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  59.73 
 
 
464 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  57.08 
 
 
496 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  50.11 
 
 
460 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1875  sugar transferase  49.04 
 
 
477 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  47.22 
 
 
472 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  49.02 
 
 
461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  45.39 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.74 
 
 
465 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2680  sugar transferase  43.84 
 
 
474 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0796334  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  42.31 
 
 
484 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  45.39 
 
 
466 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  46.41 
 
 
469 aa  359  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  54.6 
 
 
393 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  48.7 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.31 
 
 
472 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.51 
 
 
466 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  49.23 
 
 
464 aa  336  5.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50.15 
 
 
464 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  50.15 
 
 
464 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.15 
 
 
464 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50.15 
 
 
464 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  50.15 
 
 
464 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50.15 
 
 
464 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50.15 
 
 
464 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50.15 
 
 
464 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.62 
 
 
467 aa  334  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  47.2 
 
 
468 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.41 
 
 
465 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  45.38 
 
 
464 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  41.86 
 
 
466 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.05 
 
 
454 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.9 
 
 
468 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.92 
 
 
468 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50 
 
 
464 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50 
 
 
464 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50 
 
 
464 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50 
 
 
464 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  50 
 
 
464 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.51 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.61 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.79 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.68 
 
 
474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  44.56 
 
 
469 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  42.49 
 
 
454 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  39.71 
 
 
464 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.93 
 
 
471 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  39.77 
 
 
461 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  38.97 
 
 
468 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  51.13 
 
 
459 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.58 
 
 
346 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  43.13 
 
 
456 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  38.25 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.63 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  42.38 
 
 
477 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.48 
 
 
460 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.8 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.48 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  38.48 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.67 
 
 
477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  39.51 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  45.6 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.05 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  37.44 
 
 
465 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  41.64 
 
 
460 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.64 
 
 
460 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.64 
 
 
460 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.64 
 
 
461 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  41.64 
 
 
460 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  41.64 
 
 
460 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.61 
 
 
465 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.39 
 
 
516 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  41.64 
 
 
460 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.99 
 
 
465 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.31 
 
 
461 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.91 
 
 
473 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  37.27 
 
 
457 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.5 
 
 
518 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.5 
 
 
536 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2863  sugar transferase  41.94 
 
 
470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.69 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.01 
 
 
475 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  45.76 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.44 
 
 
445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.42 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.66 
 
 
468 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  47.58 
 
 
459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.07 
 
 
517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.89 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  37.89 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  37.89 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  49.04 
 
 
471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.33 
 
 
458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.2 
 
 
505 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  36.79 
 
 
467 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.74 
 
 
472 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.3 
 
 
506 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.98 
 
 
465 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.66 
 
 
468 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.66 
 
 
468 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>