More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1536 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  74.17 
 
 
484 aa  736    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  100 
 
 
484 aa  985    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  99.17 
 
 
484 aa  978    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.46 
 
 
472 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.13 
 
 
471 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.53 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.79 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.61 
 
 
471 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.98 
 
 
464 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.77 
 
 
465 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.97 
 
 
461 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.19 
 
 
461 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  39.13 
 
 
466 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.71 
 
 
460 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  35.65 
 
 
460 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  35.65 
 
 
460 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.71 
 
 
460 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.42 
 
 
461 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  35.65 
 
 
460 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.71 
 
 
460 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.71 
 
 
461 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.58 
 
 
477 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.38 
 
 
461 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  39.21 
 
 
456 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.25 
 
 
468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  35.61 
 
 
457 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  37.64 
 
 
484 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.89 
 
 
445 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.58 
 
 
471 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.62 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  44.95 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.76 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.66 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  32.69 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.13 
 
 
464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.35 
 
 
471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.13 
 
 
464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  39.13 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.13 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.13 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  39.13 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.27 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  48.4 
 
 
471 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.13 
 
 
464 aa  282  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.62 
 
 
458 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  34.12 
 
 
471 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.48 
 
 
460 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.29 
 
 
469 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  32.48 
 
 
460 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.13 
 
 
464 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.01 
 
 
475 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.12 
 
 
465 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.5 
 
 
461 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.26 
 
 
460 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  35.6 
 
 
469 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.27 
 
 
464 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.27 
 
 
464 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.27 
 
 
464 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.27 
 
 
464 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  33.91 
 
 
465 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  37.02 
 
 
467 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.98 
 
 
468 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.02 
 
 
464 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.53 
 
 
468 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.53 
 
 
468 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.53 
 
 
468 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.69 
 
 
465 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  35.18 
 
 
459 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.76 
 
 
457 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  34.76 
 
 
478 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  34.76 
 
 
478 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  38.19 
 
 
469 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  35.61 
 
 
466 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  33.98 
 
 
459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.3 
 
 
464 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.74 
 
 
346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  34.78 
 
 
468 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.93 
 
 
460 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  34.17 
 
 
477 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.38 
 
 
496 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.9 
 
 
466 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  36.38 
 
 
464 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.23 
 
 
466 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.54 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  38.18 
 
 
461 aa  262  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3640  sugar transferase  47.58 
 
 
462 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.06 
 
 
454 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  36.48 
 
 
477 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  32.85 
 
 
508 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4114  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.21 
 
 
472 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  32.51 
 
 
510 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  34.82 
 
 
450 aa  257  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.75 
 
 
473 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.75 
 
 
473 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  41.69 
 
 
464 aa  256  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.96 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  33.41 
 
 
514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  33.75 
 
 
473 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39 
 
 
468 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.98 
 
 
468 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>