More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3149 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3149  inner-membrane translocator  100 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.766269  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3376  inner-membrane translocator  96.91 
 
 		 324 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3773  inner-membrane translocator  51.96 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0402926  hitchhiker  0.00264869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3059  inner-membrane translocator  53.19 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00456062  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2858  inner-membrane translocator  50.93 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0782878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20610  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  53.75 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2957  leucine/isoleucine/valine transport system permease protein  48.72 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0342  inner-membrane translocator  50.8 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.85222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2956  inner-membrane translocator  52.1 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.176313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3034  inner-membrane translocator  53.17 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3019  inner-membrane translocator  53.17 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3065  inner-membrane translocator  53.17 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1083  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.913177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2842  inner-membrane translocator  52.41 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.37 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.37 
 
 		 316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.37 
 
 		 316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  47.09 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.06 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1893  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229898  normal  0.0495469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2976  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3573  inner-membrane translocator  51.06 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.552593  normal  0.0123888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  41.74 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.12 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  41.43 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.77 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  42.45 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  42.45 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 316 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.51 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2038  inner-membrane translocator  50.32 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.865574  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0586  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.27 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  45 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  42.68 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  41.77 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  39.94 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  40.32 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  44.03 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  44.03 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  40.25 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.25 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  38.91 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  42.9 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  40 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  40 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1206  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00220117  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  38.59 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  39.31 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.3 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>