More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3059 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3059  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  666    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00456062  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20610  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  79.94 
 
 		 348 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2842  inner-membrane translocator  76.88 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3573  inner-membrane translocator  76.65 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.552593  normal  0.0123888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3034  inner-membrane translocator  74.57 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3019  inner-membrane translocator  76.65 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3065  inner-membrane translocator  76.65 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  53.59 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2957  leucine/isoleucine/valine transport system permease protein  53.56 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2858  inner-membrane translocator  53.31 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0782878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3773  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0402926  hitchhiker  0.00264869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3376  inner-membrane translocator  54.55 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0297907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3149  inner-membrane translocator  53.19 
 
 		 324 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.766269  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0342  inner-membrane translocator  52.47 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.85222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1083  inner-membrane translocator  49.69 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.913177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2956  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.176313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2038  inner-membrane translocator  48.9 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.865574  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2976  inner-membrane translocator  45.95 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1893  inner-membrane translocator  45.92 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229898  normal  0.0495469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5685  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 316 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1206  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00220117  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 292 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  41.14 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  40.18 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  41.1 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  41.77 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.14 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.39 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.48 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 304 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.3 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  38.3 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.6 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.3 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 316 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 304 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 316 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 316 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.58 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.25 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  38.46 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2651  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  38.22 
 
 		 302 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  41.19 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.85 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.23 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  37.89 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.85 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  37.85 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.06 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1862  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2307  inner-membrane translocator  41.54 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>