More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1862 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1862  inner-membrane translocator  100 
 
 		 388 aa  741    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1893  inner-membrane translocator  67.68 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229898  normal  0.0495469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2976  inner-membrane translocator  66.92 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  53.64 
 
 		 320 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1206  inner-membrane translocator  50.6 
 
 		 337 aa  275  9e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00220117  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2651  inner-membrane translocator  51.84 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000892409  hitchhiker  0.00872106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  44.38 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.54 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.54 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  45.23 
 
 		 316 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.23 
 
 		 316 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  45.62 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.23 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  44.41 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.62 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  44.38 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  47.65 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  45.62 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  45.17 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.31 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 316 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 319 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 316 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  44.31 
 
 		 316 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 319 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  45.34 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  48.06 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 308 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 308 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  45.23 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.23 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 308 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  44 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  44 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  44 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 309 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  44 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  44.58 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  44 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.96 
 
 		 308 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 		 308 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 		 308 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  43.44 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 316 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  44.67 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.77 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.31 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  46.89 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 302 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 309 aa  233  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 309 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  44.1 
 
 		 305 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  45 
 
 		 301 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  41.54 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.5 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.72 
 
 		 291 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.44 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 300 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 290 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 304 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4330  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 305 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.06779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  39.76 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1729  inner-membrane translocator  49.22 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 301 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  44.17 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0586  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  40.37 
 
 		 300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  40.37 
 
 		 300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.65 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 304 aa  222  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  38.42 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 301 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1747  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  40.31 
 
 		 300 aa  219  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>