More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2647 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2647  condensation domain-containing protein  100 
 
 
670 aa  1316    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401117  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2079  condensation domain-containing protein  91.49 
 
 
670 aa  1184    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.262269  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.74 
 
 
3252 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  32.58 
 
 
1157 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  32.38 
 
 
1157 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  26.72 
 
 
1514 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  28.52 
 
 
2230 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.22 
 
 
3002 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.02 
 
 
3021 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  31.17 
 
 
2350 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  31.27 
 
 
4165 aa  204  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  29.11 
 
 
3739 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  30.45 
 
 
4268 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  31.84 
 
 
2619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  32.06 
 
 
2258 aa  193  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  30.86 
 
 
2057 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  30.82 
 
 
2310 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  30.67 
 
 
2706 aa  190  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  31.02 
 
 
2243 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 
2226 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  29.36 
 
 
3194 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  26 
 
 
2336 aa  187  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  31.32 
 
 
1835 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  31.21 
 
 
1734 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  25.81 
 
 
2338 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  25.81 
 
 
2345 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
2200 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  30.73 
 
 
3173 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  30.2 
 
 
1131 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  30.45 
 
 
1167 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  30.45 
 
 
1167 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  29.69 
 
 
2035 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  30.45 
 
 
1167 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  29.98 
 
 
3275 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 
1174 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  30.98 
 
 
1884 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  28.9 
 
 
3163 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  30.93 
 
 
2174 aa  170  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  26.78 
 
 
3293 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  30.47 
 
 
1414 aa  168  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  29.97 
 
 
1152 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  28.87 
 
 
2006 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 
1321 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  31.3 
 
 
1149 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  28.08 
 
 
2896 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  25.75 
 
 
1497 aa  162  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  26.37 
 
 
3875 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  25.61 
 
 
1837 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  28.25 
 
 
1678 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.5 
 
 
1113 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  33.07 
 
 
1845 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  29.22 
 
 
1837 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  31.93 
 
 
1163 aa  156  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  27.16 
 
 
1104 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  26.84 
 
 
1897 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.8 
 
 
1487 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  27.31 
 
 
1888 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  29.51 
 
 
1809 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  24.72 
 
 
1862 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  29.16 
 
 
2084 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  29.4 
 
 
2023 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  26.16 
 
 
1193 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  30.75 
 
 
2454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  29.05 
 
 
1824 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  27.96 
 
 
1809 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1766  condensation domain protein  19.01 
 
 
921 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  30.39 
 
 
1317 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  28.69 
 
 
2090 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  29.82 
 
 
1825 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  29.82 
 
 
1825 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  28.55 
 
 
1469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  29.4 
 
 
1894 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
1825 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3015  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 
1903 aa  130  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  28.34 
 
 
1326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  24.59 
 
 
1158 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  27.21 
 
 
1438 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  26.81 
 
 
1436 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  25.22 
 
 
1889 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  29.13 
 
 
1511 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  29.13 
 
 
1501 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  29.13 
 
 
1489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1801  nonribosomal peptide synthetase VibF  27.6 
 
 
2417 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  27.86 
 
 
1457 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  27.86 
 
 
1457 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 
2257 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02101  hypothetical protein  23.2 
 
 
958 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  29.07 
 
 
1457 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  24.89 
 
 
9498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  27.99 
 
 
1463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  27.29 
 
 
1084 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  27.32 
 
 
4882 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1631  non-ribosomal peptide synthetase  24.51 
 
 
978 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  27.42 
 
 
13537 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  25.82 
 
 
4531 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  26.34 
 
 
6676 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  25.65 
 
 
5953 aa  100  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  26.26 
 
 
6889 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  23.32 
 
 
7122 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  27.1 
 
 
5372 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>