More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2079 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2647  condensation domain-containing protein  91.97 
 
 
670 aa  1172    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401117  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2079  condensation domain-containing protein  100 
 
 
670 aa  1321    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.262269  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.56 
 
 
3252 aa  226  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  32.18 
 
 
1157 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  31.98 
 
 
1157 aa  220  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.14 
 
 
3002 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  31.83 
 
 
4165 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  26.14 
 
 
1514 aa  216  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  28.78 
 
 
2230 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.07 
 
 
3021 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  32.66 
 
 
2350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  32.59 
 
 
2619 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  28.96 
 
 
3739 aa  200  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  31.88 
 
 
4268 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  31.45 
 
 
2258 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 
2706 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  30.94 
 
 
2310 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  31.2 
 
 
2226 aa  193  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  29.4 
 
 
3194 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  31.07 
 
 
2243 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  26.53 
 
 
2336 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  29.74 
 
 
2057 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  31.37 
 
 
1835 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  26.34 
 
 
2345 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  26.34 
 
 
2338 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  30.93 
 
 
1131 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  31.08 
 
 
1734 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  31.38 
 
 
1414 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  31.59 
 
 
1174 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 
2174 aa  177  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  29.98 
 
 
3275 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  29.63 
 
 
3173 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  30.56 
 
 
1884 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  30.17 
 
 
1167 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  30.17 
 
 
1167 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  30.17 
 
 
1167 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  30.22 
 
 
1321 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  26.58 
 
 
2035 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  28.52 
 
 
3163 aa  169  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  26.24 
 
 
1497 aa  169  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  30.22 
 
 
1837 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  28.33 
 
 
2896 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  26.35 
 
 
3293 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  30.6 
 
 
2006 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  29.04 
 
 
2200 aa  163  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  31.58 
 
 
1149 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  25.46 
 
 
1837 aa  162  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  25.86 
 
 
3875 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  28.27 
 
 
1678 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  27.58 
 
 
1104 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.97 
 
 
1113 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  29.52 
 
 
1152 aa  158  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  27.21 
 
 
1193 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  27.53 
 
 
1897 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  31.71 
 
 
1163 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.26 
 
 
1487 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  28.55 
 
 
1845 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  27.53 
 
 
1888 aa  153  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  30.04 
 
 
2023 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  30.04 
 
 
2084 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  24.84 
 
 
1862 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  28.85 
 
 
1809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  29.59 
 
 
2090 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  28.42 
 
 
1469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  29.55 
 
 
1326 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 
1317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1766  condensation domain protein  19.89 
 
 
921 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  29.22 
 
 
1824 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  27.85 
 
 
1438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  27.49 
 
 
1809 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  28.98 
 
 
1894 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  29.8 
 
 
1825 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 
1825 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3015  amino acid adenylation domain-containing protein  31.26 
 
 
1903 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  29.94 
 
 
2454 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  26.98 
 
 
1436 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
1825 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  23.9 
 
 
1158 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  28.26 
 
 
1457 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  28.26 
 
 
1457 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  27.4 
 
 
1084 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  25.27 
 
 
1889 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  28.52 
 
 
1457 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1801  nonribosomal peptide synthetase VibF  27.17 
 
 
2417 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02101  hypothetical protein  23.65 
 
 
958 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  27.29 
 
 
2257 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  25.45 
 
 
9498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29.2 
 
 
4882 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  27.63 
 
 
1511 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  27.63 
 
 
1489 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  27.83 
 
 
1501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  27.29 
 
 
1463 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  27.08 
 
 
5953 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1631  non-ribosomal peptide synthetase  23.79 
 
 
978 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  26.02 
 
 
6889 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  26.94 
 
 
6676 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  27.04 
 
 
13537 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.25 
 
 
4531 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  26.52 
 
 
5372 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  25.33 
 
 
5926 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>