More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3015 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3015  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1903 aa  3724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1801  nonribosomal peptide synthetase VibF  41.33 
 
 		 2417 aa  1027    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1631  non-ribosomal peptide synthetase  36.1 
 
 		 978 aa  556  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02101  hypothetical protein  35.1 
 
 		 958 aa  513  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0978  condensation domain-containing protein  50.91 
 
 		 986 aa  499  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.460756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1634  AMP-dependent synthetase and ligase  45.49 
 
 		 621 aa  433  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02109  hypothetical protein  42 
 
 		 711 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  25.36 
 
 		 2336 aa  407  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  25.14 
 
 		 2345 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  24.91 
 
 		 2338 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1638  condensation domain-containing protein  40.12 
 
 		 718 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  29.46 
 
 		 1745 aa  396  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  29.42 
 
 		 1745 aa  393  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  29.42 
 
 		 1745 aa  393  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12405  peptide synthetase mbtE  28.27 
 
 		 1731 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.517103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  29.63 
 
 		 3761 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 		 2174 aa  380  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  30.66 
 
 		 2561 aa  380  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  28.7 
 
 		 2365 aa  380  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.1 
 
 		 5738 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 		 1157 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 		 1157 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.67 
 
 		 7785 aa  376  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 		 1514 aa  373  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  29.06 
 
 		 6403 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  27.61 
 
 		 2386 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  30.86 
 
 		 4290 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  26.06 
 
 		 1569 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.42 
 
 		 6889 aa  370  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.2 
 
 		 3021 aa  370  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  30.22 
 
 		 2614 aa  370  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  28.62 
 
 		 1721 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  33.27 
 
 		 2350 aa  367  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  31.67 
 
 		 1084 aa  367  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  24.6 
 
 		 4968 aa  365  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  24 
 
 		 2581 aa  364  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  27.23 
 
 		 4336 aa  364  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  28.12 
 
 		 5953 aa  362  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  24.14 
 
 		 4960 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  27.79 
 
 		 3252 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  29.2 
 
 		 3875 aa  360  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.52 
 
 		 1487 aa  360  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.44 
 
 		 2385 aa  359  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 		 8211 aa  358  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  31.13 
 
 		 1104 aa  356  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.38 
 
 		 2385 aa  356  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0624  amino acid adenylation domain protein  29.05 
 
 		 1693 aa  356  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  27.41 
 
 		 1762 aa  355  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  29.08 
 
 		 3293 aa  355  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  28.36 
 
 		 4991 aa  355  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  30.6 
 
 		 2258 aa  355  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.47 
 
 		 2385 aa  355  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.72 
 
 		 3002 aa  353  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  24.01 
 
 		 4960 aa  352  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.31 
 
 		 2385 aa  352  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  25.1 
 
 		 2138 aa  350  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  26.89 
 
 		 2386 aa  350  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  27.7 
 
 		 2385 aa  350  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  25.08 
 
 		 7122 aa  349  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.09 
 
 		 4489 aa  349  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  27.55 
 
 		 4336 aa  347  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.86 
 
 		 13537 aa  347  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  32.35 
 
 		 3352 aa  346  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  32.35 
 
 		 3328 aa  346  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.7 
 
 		 6006 aa  345  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.94 
 
 		 6081 aa  345  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  34.29 
 
 		 2084 aa  344  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  34.29 
 
 		 2023 aa  344  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.98 
 
 		 6072 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.19 
 
 		 5213 aa  344  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  29.25 
 
 		 4449 aa  343  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.87 
 
 		 6676 aa  343  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  29.15 
 
 		 2619 aa  342  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  23.42 
 
 		 1870 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.45 
 
 		 2385 aa  342  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  31.42 
 
 		 2896 aa  342  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.45 
 
 		 2385 aa  342  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.32 
 
 		 4531 aa  341  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.35 
 
 		 2385 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.31 
 
 		 6661 aa  340  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  27.99 
 
 		 4318 aa  340  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  28.26 
 
 		 5750 aa  340  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.06 
 
 		 2385 aa  339  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  30.23 
 
 		 3194 aa  339  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.49 
 
 		 7310 aa  338  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  30.19 
 
 		 5620 aa  338  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  33.95 
 
 		 2090 aa  337  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  23.28 
 
 		 1870 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  30.13 
 
 		 4520 aa  336  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  25.95 
 
 		 3470 aa  335  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  28.6 
 
 		 4478 aa  335  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.52 
 
 		 2370 aa  335  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  28.97 
 
 		 2098 aa  334  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.56 
 
 		 5372 aa  334  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 		 7712 aa  333  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.91 
 
 		 2448 aa  333  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  25.99 
 
 		 3432 aa  333  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  32.61 
 
 		 1321 aa  332  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  29.21 
 
 		 3223 aa  331  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  24.91 
 
 		 2054 aa  331  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>