More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1801 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0978  condensation domain-containing protein  39.02 
 
 
986 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.460756  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3015  amino acid adenylation domain-containing protein  41.43 
 
 
1903 aa  966    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1801  nonribosomal peptide synthetase VibF  100 
 
 
2417 aa  4992    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1631  non-ribosomal peptide synthetase  37.53 
 
 
978 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02101  hypothetical protein  36.25 
 
 
958 aa  550  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1634  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 
621 aa  451  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509052  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02109  hypothetical protein  39.66 
 
 
711 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1638  condensation domain-containing protein  39.32 
 
 
718 aa  374  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  28.34 
 
 
1514 aa  353  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  29.14 
 
 
1157 aa  352  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  28.01 
 
 
2336 aa  351  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  28.05 
 
 
2338 aa  350  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  29.35 
 
 
1157 aa  350  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  27.9 
 
 
2345 aa  348  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  29.31 
 
 
3002 aa  347  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  29.31 
 
 
3021 aa  341  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  28.31 
 
 
3194 aa  323  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  27.27 
 
 
2230 aa  316  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  27.42 
 
 
3252 aa  311  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  26.91 
 
 
2258 aa  311  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  29.02 
 
 
1158 aa  310  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  28.68 
 
 
1321 aa  310  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  28.77 
 
 
1104 aa  305  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  28.15 
 
 
2619 aa  304  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.01 
 
 
1487 aa  304  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 
1734 aa  304  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  28.27 
 
 
1835 aa  304  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  28.36 
 
 
1131 aa  300  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  28.51 
 
 
2057 aa  301  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  28.75 
 
 
1326 aa  298  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  26.31 
 
 
3739 aa  298  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  28.19 
 
 
1862 aa  298  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.99 
 
 
1113 aa  295  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  27.25 
 
 
2896 aa  294  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  27.92 
 
 
1894 aa  292  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  28.6 
 
 
3293 aa  286  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  25.54 
 
 
2454 aa  287  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  27.24 
 
 
2350 aa  286  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  25.59 
 
 
1497 aa  286  5.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  28.48 
 
 
3875 aa  285  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  27.97 
 
 
2084 aa  281  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  27.72 
 
 
1084 aa  280  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  28.16 
 
 
4165 aa  280  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  27.99 
 
 
2090 aa  280  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  37.44 
 
 
1174 aa  279  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  27.86 
 
 
2023 aa  279  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  28.04 
 
 
1825 aa  277  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  28.04 
 
 
1825 aa  277  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  28.26 
 
 
1837 aa  276  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  28.71 
 
 
1436 aa  276  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  28.04 
 
 
1825 aa  274  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  27.95 
 
 
1824 aa  274  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  25.08 
 
 
1889 aa  273  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  26.48 
 
 
4747 aa  272  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  29.44 
 
 
1438 aa  272  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.92 
 
 
1336 aa  271  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  26.99 
 
 
2174 aa  270  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  30.77 
 
 
1457 aa  268  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  30.77 
 
 
1457 aa  268  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  27.74 
 
 
6403 aa  267  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  28.63 
 
 
1845 aa  267  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  26.75 
 
 
2200 aa  266  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  29.33 
 
 
1489 aa  265  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  28.1 
 
 
1463 aa  264  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  25.5 
 
 
2752 aa  264  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  29.33 
 
 
1501 aa  265  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  27.88 
 
 
2035 aa  264  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  26.78 
 
 
1167 aa  264  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  26.52 
 
 
1837 aa  263  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  28.81 
 
 
1469 aa  263  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  35.83 
 
 
1678 aa  262  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  27.63 
 
 
1163 aa  261  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  26.68 
 
 
1167 aa  259  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  26.68 
 
 
1167 aa  259  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  28.97 
 
 
1884 aa  259  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  28.51 
 
 
4268 aa  258  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.84 
 
 
4882 aa  258  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  34.83 
 
 
1149 aa  257  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  28.37 
 
 
1809 aa  256  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  27.44 
 
 
2125 aa  256  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  29.41 
 
 
1870 aa  255  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  30.06 
 
 
1457 aa  255  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  29.58 
 
 
1870 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  26.33 
 
 
1093 aa  254  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  31.09 
 
 
1042 aa  253  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  28.78 
 
 
1511 aa  253  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  26.98 
 
 
2151 aa  253  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  27.27 
 
 
1809 aa  253  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  24.13 
 
 
1193 aa  252  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.5 
 
 
6676 aa  251  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  26.49 
 
 
2156 aa  251  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  32.9 
 
 
5422 aa  251  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.48 
 
 
2370 aa  249  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  31.91 
 
 
2596 aa  248  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  25.31 
 
 
5213 aa  247  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.97 
 
 
4531 aa  247  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  25.5 
 
 
2156 aa  247  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  27.19 
 
 
1317 aa  247  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  35.07 
 
 
1152 aa  247  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.9 
 
 
2883 aa  247  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>