75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2298 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 420 aa  837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  26.85 
 
 		 623 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  27.9 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3234  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  26.74 
 
 		 615 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  31.14 
 
 		 634 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  26.57 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  26.57 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  28.1 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  26.83 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  25.64 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  23.98 
 
 		 773 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  27.86 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  32.94 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0508  peptidase M48 Ste24p  28.45 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3307  heat shock protein HtpX  25.93 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4377  peptidase M48, Ste24p  24.43 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0546446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  27.11 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  25.2 
 
 		 281 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  25.73 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  26.92 
 
 		 305 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  28.26 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  25.67 
 
 		 713 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  25.12 
 
 		 320 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  26.92 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2189  heat shock protein HtpX  29.82 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.436394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0267  heat shock protein HtpX  27.74 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  25.62 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2100  heat shock protein HtpX  28 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  25.71 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  21.85 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2215  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2395  heat shock protein HtpX  25.1 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  25.81 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  26.38 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  27.74 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  28.36 
 
 		 334 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  28.38 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4314  peptidase M48, Ste24p  26.53 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1352  heat shock protein HtpX  30.93 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2524  heat shock protein HtpX  24 
 
 		 290 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0533097  normal  0.490603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  31.82 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  25.71 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  26.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  26.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  24.65 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  26.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1480  heat shock protein HtpX  25.54 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  26.74 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  22.14 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0986  heat shock protein HtpX  24.18 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.419711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3464  heat shock protein HtpX  22.45 
 
 		 292 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 		 621 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  23.61 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  24.9 
 
 		 285 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00404  heat shock protein HtpX  27.24 
 
 		 292 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1446  heat shock protein HtpX  25.42 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.501086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  25.61 
 
 		 293 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  27.21 
 
 		 343 aa  43.5  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  29.13 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  25.2 
 
 		 485 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  26.27 
 
 		 348 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2314  putative protease htpX  31.33 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3844  heat shock protein HtpX  25.54 
 
 		 295 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00537908  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1871  heat shock protein HtpX  25.54 
 
 		 295 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>