55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7083 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  100 
 
 		 713 aa  1486    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 708 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  26.28 
 
 		 773 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 		 510 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  24.1 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  24.32 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  25.51 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  27.72 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  23.59 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  26.49 
 
 		 617 aa  63.9  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  25.95 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  34.83 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  26.26 
 
 		 292 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  24.15 
 
 		 621 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  36.25 
 
 		 495 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  36.25 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 		 296 aa  51.6  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  23.29 
 
 		 287 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  24.91 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  22.13 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  33.33 
 
 		 285 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  21.47 
 
 		 282 aa  48.9  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 		 279 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  23.57 
 
 		 296 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  25.29 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  24.31 
 
 		 285 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  24.47 
 
 		 285 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  20.52 
 
 		 432 aa  47.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  22.83 
 
 		 287 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  23.46 
 
 		 283 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  22.46 
 
 		 282 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  23.81 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  25 
 
 		 286 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  23.56 
 
 		 287 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  29.44 
 
 		 319 aa  46.6  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  26.94 
 
 		 291 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  27.75 
 
 		 281 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  28.98 
 
 		 330 aa  46.6  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0965  peptidase M48 Ste24p  30.07 
 
 		 325 aa  45.8  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  26.82 
 
 		 320 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  22.36 
 
 		 296 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  28 
 
 		 285 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  20.09 
 
 		 274 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3151  hypothetical protein  25.1 
 
 		 664 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  25.26 
 
 		 283 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  22.84 
 
 		 282 aa  45.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  24.87 
 
 		 485 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 280 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2100  heat shock protein HtpX  24.64 
 
 		 289 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 280 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  28.35 
 
 		 283 aa  44.3  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1286  peptidase M48 Ste24p  23.39 
 
 		 295 aa  44.3  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2189  heat shock protein HtpX  24.64 
 
 		 289 aa  44.3  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.436394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>