21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2726 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  59.48 
 
 		 620 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  95.35 
 
 		 645 aa  1209    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 623 aa  1237    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  56.77 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  29.56 
 
 		 634 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  32.9 
 
 		 615 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  32.58 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  28.39 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  31.23 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  24.28 
 
 		 773 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 		 623 aa  64.7  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  23.59 
 
 		 713 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  22.16 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 		 621 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  31.07 
 
 		 495 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  27.51 
 
 		 285 aa  47.4  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  25.61 
 
 		 285 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  25.2 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  25.61 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>