31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3140 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
623 aa  1201    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  38 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
522 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  28.41 
 
 
510 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  27.62 
 
 
634 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  23.57 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1718  hypothetical protein  31.58 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.771633  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  29.84 
 
 
615 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  26.09 
 
 
713 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3412  hypothetical protein  38.05 
 
 
263 aa  77  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37765  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
617 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  23.92 
 
 
708 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 
623 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  28.17 
 
 
645 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 
620 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  27.97 
 
 
495 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  32.04 
 
 
621 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  30.31 
 
 
615 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  29.12 
 
 
495 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  27.21 
 
 
337 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0280  hypothetical protein  26.93 
 
 
468 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  34.88 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  36.96 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2532  heat shock protein HtpX  26.35 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  27.93 
 
 
723 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  29.5 
 
 
399 aa  45.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  29.05 
 
 
296 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  26.16 
 
 
320 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  30.77 
 
 
415 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2230  heat shock protein HtpX  27.89 
 
 
322 aa  44.3  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  38.57 
 
 
433 aa  43.9  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>