51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1714 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 708 aa  1469    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  31.41 
 
 		 713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  28.03 
 
 		 773 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  24.72 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  24.19 
 
 		 623 aa  72.4  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  25.33 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  23.22 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  24.8 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  26.49 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  21.03 
 
 		 623 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6048  hypothetical protein  37.23 
 
 		 136 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184107  normal  0.0647428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  26.98 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  20.14 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  21.72 
 
 		 279 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  25.11 
 
 		 296 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  24.44 
 
 		 285 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  27.19 
 
 		 297 aa  55.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  34.94 
 
 		 495 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  24.34 
 
 		 296 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  23.35 
 
 		 617 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  33.73 
 
 		 495 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  23.18 
 
 		 285 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  26.87 
 
 		 292 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 281 aa  49.7  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  25.63 
 
 		 295 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  24.78 
 
 		 287 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  23.98 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  24.69 
 
 		 292 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  24.08 
 
 		 285 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  26.63 
 
 		 334 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  26.27 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  24.74 
 
 		 620 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  24.47 
 
 		 285 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  23.11 
 
 		 286 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  26.67 
 
 		 396 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  27.48 
 
 		 289 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  25.45 
 
 		 287 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  26.81 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  22.32 
 
 		 287 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  24.87 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  27.01 
 
 		 300 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  22.55 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  23.04 
 
 		 304 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  25.2 
 
 		 296 aa  45.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  28.8 
 
 		 337 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  25.29 
 
 		 293 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  25.13 
 
 		 282 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  26.81 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1805  heat shock protein HtpX  28.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00990556  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3307  heat shock protein HtpX  25.3 
 
 		 292 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  21.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>