19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2984 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
495 aa  905    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  95.15 
 
 
495 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  94.55 
 
 
495 aa  759    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  28.16 
 
 
522 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  31.29 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
503 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  29.81 
 
 
623 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 
708 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  24.9 
 
 
773 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  23.61 
 
 
713 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  33.89 
 
 
485 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  29.07 
 
 
634 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  33.74 
 
 
485 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 
645 aa  54.3  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 
623 aa  53.5  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  25.94 
 
 
615 aa  53.5  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 
620 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 
617 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  27.48 
 
 
398 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.589111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>