19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2958 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  95.26 
 
 		 485 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  950    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 		 723 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  37.55 
 
 		 705 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  37.55 
 
 		 705 aa  123  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  34.22 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  34.22 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  29.37 
 
 		 615 aa  87  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  24.28 
 
 		 621 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  32.67 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 		 296 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0535  HtpX domain protein  29.44 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0793036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  25.87 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  23.78 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  29.14 
 
 		 773 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1981  peptidase M48, Ste24p  23.33 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2603  heat shock protein HtpX  27.78 
 
 		 291 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.678894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>