147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2955 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  97.86 
 
 
514 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  993    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 
723 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 
705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  36.46 
 
 
705 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  34.98 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  34.73 
 
 
485 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  35.6 
 
 
615 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  32.21 
 
 
621 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  33.93 
 
 
321 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  29.94 
 
 
615 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.09 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  30.37 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
330 aa  57  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  27.37 
 
 
348 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  26.38 
 
 
634 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  28.5 
 
 
285 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  31.7 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  30.96 
 
 
285 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  28.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  28.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  28.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  28.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  28.97 
 
 
285 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 
321 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 
289 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 
351 aa  54.3  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  27.48 
 
 
287 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  27.69 
 
 
287 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  30 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 
503 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30.69 
 
 
283 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  26.67 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
297 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  27.42 
 
 
623 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  26.53 
 
 
278 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
292 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  34.92 
 
 
337 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
316 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  25.61 
 
 
330 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  29.28 
 
 
320 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  27.27 
 
 
289 aa  50.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  30.77 
 
 
286 aa  50.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 
325 aa  50.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  28.73 
 
 
320 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 
325 aa  50.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  28.93 
 
 
285 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  29.44 
 
 
296 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  27.46 
 
 
279 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  27.14 
 
 
311 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1859  peptidase M48 Ste24p  38.29 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  30.32 
 
 
306 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  30.77 
 
 
286 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  29.1 
 
 
292 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  28 
 
 
279 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  23.69 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  29.71 
 
 
285 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 
310 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  34.09 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  25.7 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  28.89 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  28.81 
 
 
281 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  25.7 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  27.06 
 
 
303 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  30.95 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  25.7 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  31.98 
 
 
617 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 
283 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 
296 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  31.28 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  30.95 
 
 
300 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  30.77 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 
301 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  30.81 
 
 
300 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  25.17 
 
 
295 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  31.05 
 
 
289 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  30.22 
 
 
282 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  30.77 
 
 
289 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  28.21 
 
 
299 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  27.42 
 
 
285 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  25.54 
 
 
321 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  30.32 
 
 
324 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  28.15 
 
 
286 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1192  HtpX-2 peptidase  29.46 
 
 
344 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 
287 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  26.29 
 
 
283 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  29.67 
 
 
306 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
314 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  26.73 
 
 
280 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>