More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0615 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 321 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  90.97 
 
 		 321 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  88.16 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  74.92 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  70.72 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  52.48 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  47.48 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  47.32 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  44.98 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  42.63 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  40.97 
 
 		 331 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  40.62 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  38.71 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  38.71 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  47.09 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  32.76 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  33.9 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  34.03 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  32.29 
 
 		 285 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  33.79 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  33.45 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  32.64 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  32.99 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  32.18 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  33.22 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  31.6 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  32.29 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  32.29 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  33.56 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  31.01 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  31.8 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  32.17 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  33.1 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  33.33 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  34.15 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  32.39 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  33.57 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  32.06 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  33.57 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  32.5 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  33.56 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  30.45 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  32.17 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  32.64 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  34.07 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  32.18 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  32.87 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  32.06 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  32.86 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  35.22 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  32.55 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  33.46 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  34.33 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  31.23 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.3 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.25 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  36.06 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  31.91 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  32.17 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  31.91 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  32.63 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  32.63 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  35.38 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  31.31 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  35.5 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  33.68 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  34.92 
 
 		 296 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  35.25 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  35.15 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  32.85 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  29.33 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  31.69 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  33.21 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.05 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  32.64 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  34.73 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  31.96 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  32.11 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>