More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0550 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
320 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  46.48 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  43.11 
 
 
313 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  43.11 
 
 
313 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  43.96 
 
 
316 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  45.9 
 
 
321 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  46.6 
 
 
319 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  42.95 
 
 
331 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  46.9 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  42.62 
 
 
331 aa  195  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  43.17 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  42.57 
 
 
330 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  43.05 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  44.65 
 
 
321 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  43.62 
 
 
321 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  36.6 
 
 
296 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  36.23 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  32.18 
 
 
288 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30.82 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  31.19 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  34.74 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  35.95 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  33.57 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  32.53 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  32.53 
 
 
320 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  34.27 
 
 
307 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  31.49 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  35.31 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  32.17 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  35.44 
 
 
295 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  33.1 
 
 
318 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  31.01 
 
 
296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  31.21 
 
 
306 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  35.51 
 
 
291 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  34.59 
 
 
294 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  36.13 
 
 
296 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
285 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.99 
 
 
285 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 
296 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  30.98 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  30.98 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  32.03 
 
 
287 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  30.85 
 
 
286 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  30.18 
 
 
279 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  32.9 
 
 
312 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 
292 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  32.32 
 
 
282 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  30.31 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  34.72 
 
 
283 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  32.64 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  30.3 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  30.64 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  30.64 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  30.64 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  29.87 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  29.19 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  30.63 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  34.08 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  35.52 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
308 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  29.15 
 
 
282 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  32.24 
 
 
286 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 
297 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  31.14 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.31 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 
283 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  29.77 
 
 
286 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  33.22 
 
 
290 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  30.2 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  36.77 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  31.82 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  31.82 
 
 
280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  30.94 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  29.87 
 
 
286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  30.04 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  31.65 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  34.19 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  33.1 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  33.1 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  33.1 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  31.56 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  32.31 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  33.21 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  31.92 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  32.88 
 
 
291 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  32.88 
 
 
291 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  32.88 
 
 
291 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>