More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1109 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
316 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  50.8 
 
 
319 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  47.48 
 
 
321 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  49.83 
 
 
330 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  48.42 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  48.55 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  47.48 
 
 
321 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  47.27 
 
 
321 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  48.07 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  43.63 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  40.58 
 
 
313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  40.58 
 
 
313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  39.93 
 
 
331 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  48.18 
 
 
320 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  39.59 
 
 
331 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  34.95 
 
 
306 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  35.89 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  33.8 
 
 
285 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  35.29 
 
 
286 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  33.68 
 
 
285 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  33.68 
 
 
285 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  33.45 
 
 
296 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  33.11 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  33.33 
 
 
285 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  32.99 
 
 
285 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  35.42 
 
 
317 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  33.22 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  32.87 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  32.1 
 
 
342 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
319 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.1 
 
 
286 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  33.45 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  31.49 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  35.31 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  32.38 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  36.17 
 
 
307 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  33.45 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  30.98 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  33.22 
 
 
343 aa  129  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  33.44 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  34.25 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  34.13 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  36.75 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  34.29 
 
 
315 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  33.69 
 
 
310 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  34.04 
 
 
286 aa  122  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  32.38 
 
 
316 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33.21 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  32.89 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  38.96 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  31.25 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  31.85 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  34.81 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  34.43 
 
 
289 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  30.42 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  31.63 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  34.1 
 
 
290 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  31.91 
 
 
300 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 
292 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  31.91 
 
 
300 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  31.69 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  32.16 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 
283 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  30.45 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  32.36 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  33.11 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  33.79 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  33.9 
 
 
290 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  32.76 
 
 
309 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  29.62 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  29.89 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  31.06 
 
 
321 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  34.35 
 
 
285 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  32.86 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  37.18 
 
 
307 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  30.72 
 
 
325 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  30.72 
 
 
325 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  32.32 
 
 
281 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  32.27 
 
 
279 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  31.1 
 
 
286 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  30.82 
 
 
282 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  35.5 
 
 
291 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  32.78 
 
 
287 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 
306 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  34.34 
 
 
286 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>