More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1189 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  100 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  47.17 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  42.41 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  43.91 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  40.89 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  40.89 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  41.59 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  43.63 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  42.77 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  41.38 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  41.14 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  42.63 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  42.75 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  42.38 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  44.63 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  35.56 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  31.71 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  31.4 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  32.52 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  31.4 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  31.51 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  31.6 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  31.51 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.6 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  36.64 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 		 281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  31.38 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  31.85 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  31.94 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  31.16 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  31.16 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  31.16 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  31.06 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  32.14 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  32.65 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  30.85 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  29.41 
 
 		 280 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  32.18 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  34.04 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  30.85 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  32.28 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  30.33 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  31.19 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  31.27 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 		 281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  33.67 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  33.67 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 		 287 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  31.72 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  35.86 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  33.22 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  30.21 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  31.31 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  32.99 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  30.24 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  31.9 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  33.79 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  31.68 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  30.63 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  31.44 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  34.04 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  35.15 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.03 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  31.03 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  33.89 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  32.62 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  33.69 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  32.17 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  31.01 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1860  peptidase M48 Ste24p  35.47 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  34.92 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  33.96 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  31.36 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  32.37 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  32.37 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  34.47 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  32.43 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  31.6 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  30.07 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>