19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  949    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  95.26 
 
 		 485 aa  772    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 		 723 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 		 705 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 		 705 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  34.44 
 
 		 514 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  34.22 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 		 615 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  25.29 
 
 		 621 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  26.52 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  32.09 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  26.15 
 
 		 296 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0535  HtpX domain protein  29.71 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0793036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  31.72 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  26.34 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  30.91 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  25.67 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  24.87 
 
 		 713 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2603  heat shock protein HtpX  28.65 
 
 		 291 aa  43.5  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.678894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>