146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  991    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  97.86 
 
 		 514 aa  863    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 		 723 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  37.2 
 
 		 705 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  36.59 
 
 		 705 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  34.98 
 
 		 485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  35.04 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  34.19 
 
 		 615 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 		 621 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  29.94 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  29.41 
 
 		 285 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  29.91 
 
 		 285 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 283 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  29.83 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  27.84 
 
 		 285 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  28.24 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  28.24 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  28.24 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  28.97 
 
 		 285 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  28.97 
 
 		 285 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 		 623 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  27.06 
 
 		 287 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  26.34 
 
 		 289 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  26.57 
 
 		 634 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  27.02 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 		 311 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  31.47 
 
 		 321 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  30 
 
 		 279 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  29.83 
 
 		 320 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  26.88 
 
 		 325 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  29.28 
 
 		 320 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 279 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  31.98 
 
 		 321 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  26.88 
 
 		 325 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  29.44 
 
 		 313 aa  50.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  27.69 
 
 		 287 aa  50.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  28.64 
 
 		 285 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30.69 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  28.57 
 
 		 296 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  28.98 
 
 		 301 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  28.15 
 
 		 285 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  32.57 
 
 		 287 aa  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  28.94 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  33.14 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  29.81 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 316 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  25.65 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  30.77 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07590  Heat shock protein  25.57 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0578635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  24.81 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  28.81 
 
 		 281 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  27.46 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  34.92 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  30.77 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  26.09 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  26.22 
 
 		 292 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  27.7 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  26.84 
 
 		 319 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  28 
 
 		 279 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  34.29 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  26.29 
 
 		 283 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  28.15 
 
 		 286 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  27.27 
 
 		 289 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  23.69 
 
 		 309 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1859  peptidase M48 Ste24p  37.71 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  30.21 
 
 		 286 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  30.95 
 
 		 300 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  30.95 
 
 		 300 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1192  HtpX-2 peptidase  29.6 
 
 		 344 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  24.8 
 
 		 330 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  28.45 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  30.22 
 
 		 282 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 314 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  31.05 
 
 		 289 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  30.77 
 
 		 289 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  28.21 
 
 		 299 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  26.32 
 
 		 268 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 		 358 aa  47  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  27.32 
 
 		 288 aa  47  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  24.21 
 
 		 295 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  28.95 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  27.03 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  30.81 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>