35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1550 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  98.3 
 
 		 705 aa  1328    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 705 aa  1351    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 		 723 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  37.38 
 
 		 514 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  38.19 
 
 		 514 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  37.76 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  37.87 
 
 		 485 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 		 615 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  28.83 
 
 		 621 aa  84.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  23.28 
 
 		 634 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 		 503 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  26.25 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  26.73 
 
 		 348 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  24.5 
 
 		 287 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2118  heat shock protein HtpX  26.79 
 
 		 295 aa  50.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2524  heat shock protein HtpX  28.18 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0533097  normal  0.490603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0373  heat shock protein HtpX  25.88 
 
 		 290 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  25.76 
 
 		 615 aa  48.5  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3984  heat shock protein HtpX  28.65 
 
 		 295 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1778  heat shock protein HtpX  28.02 
 
 		 295 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.463341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1774  HtpX domain-containing protein  26.82 
 
 		 293 aa  47.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2215  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 		 303 aa  47.4  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0535  HtpX domain protein  26.34 
 
 		 295 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0793036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1347  heat shock protein HtpX  28.04 
 
 		 300 aa  46.2  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3142  heat shock protein HtpX  26.6 
 
 		 300 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.8089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1218  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 372 aa  45.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 		 296 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  29.88 
 
 		 289 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 351 aa  44.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3616  heat shock protein HtpX  27.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2026  peptidase M48, Ste24p  24.02 
 
 		 659 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  28.74 
 
 		 321 aa  44.3  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 420 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  29.92 
 
 		 296 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0715  HtpX domain-containing protein  26.5 
 
 		 301 aa  43.9  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>