24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4950 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4950  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 723 aa  1461    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1550  peptidase M48 Ste24p  34.28 
 
 		 705 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1349  peptidase M48 Ste24p  33.61 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362461  normal  0.588641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35020  hypothetical protein  35.53 
 
 		 514 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826733  normal  0.973873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2955  hypothetical protein  35.25 
 
 		 514 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  33.6 
 
 		 485 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  34.15 
 
 		 485 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  28.78 
 
 		 615 aa  91.3  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 		 621 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35030  hypothetical protein  34.31 
 
 		 220 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00480327  normal  0.8357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2956  hypothetical protein  34.31 
 
 		 220 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  26.8 
 
 		 522 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35010  hypothetical protein  30.5 
 
 		 211 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0875177  normal  0.828019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  26.82 
 
 		 503 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2603  heat shock protein HtpX  27.5 
 
 		 291 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.678894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2954  hypothetical protein  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  24.92 
 
 		 343 aa  47  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  27.39 
 
 		 330 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  26.78 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1114  heat shock protein HtpX  25.82 
 
 		 273 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.673422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  28.24 
 
 		 283 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 		 296 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  27.78 
 
 		 309 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>