140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3604 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1593    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  27.54 
 
 		 708 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  25.9 
 
 		 713 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03439  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  27.06 
 
 		 503 aa  94.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  23.08 
 
 		 623 aa  79.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  25.58 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  25.58 
 
 		 634 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  24.28 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  28.21 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  23.73 
 
 		 645 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  26.74 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  36.96 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  36.96 
 
 		 495 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  36.96 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  25.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  25.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  25.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  25.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  25.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 		 314 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0373  heat shock protein HtpX  26.92 
 
 		 290 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 		 620 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1674  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00952626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2662  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  56.6  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000479868  hitchhiker  0.00874622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1784  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000381435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  24.35 
 
 		 293 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  25.18 
 
 		 304 aa  55.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2118  heat shock protein HtpX  25.09 
 
 		 295 aa  55.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  24.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000337122  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1813  HtpX domain protein  24.35 
 
 		 293 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  24.32 
 
 		 279 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1883  heat shock protein HtpX  23.62 
 
 		 293 aa  54.7  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000193864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  24.3 
 
 		 296 aa  54.7  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1947  HtpX domain protein  23.87 
 
 		 294 aa  54.3  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00129769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1778  heat shock protein HtpX  25.9 
 
 		 295 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3984  heat shock protein HtpX  25.99 
 
 		 295 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1805  heat shock protein HtpX  27.91 
 
 		 287 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00990556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2058  HtpX domain protein  24.19 
 
 		 294 aa  52.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000452797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2130  heat shock protein HtpX  27.97 
 
 		 287 aa  52.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  28.27 
 
 		 291 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  25.54 
 
 		 279 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3142  heat shock protein HtpX  27.64 
 
 		 300 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.8089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3616  heat shock protein HtpX  25.6 
 
 		 295 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0715  HtpX domain-containing protein  24.15 
 
 		 301 aa  51.2  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1981  peptidase M48, Ste24p  24.48 
 
 		 297 aa  51.2  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 		 285 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  24.23 
 
 		 307 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2399  heat shock protein HtpX  23.7 
 
 		 293 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.792526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2215  peptidase M48, Ste24p  26.32 
 
 		 303 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0528  heat shock protein HtpX  25.61 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  27.18 
 
 		 286 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  23.74 
 
 		 285 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  25.21 
 
 		 318 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  26.32 
 
 		 286 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2120  heat shock protein HtpX  22.52 
 
 		 292 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000401821  hitchhiker  0.0000953283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  23.71 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15400  heat shock protein HtpX  27.89 
 
 		 289 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1871  heat shock protein HtpX  26.46 
 
 		 295 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2603  heat shock protein HtpX  28.39 
 
 		 291 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.678894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2612  peptidase M48, Ste24p  23.32 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  27.94 
 
 		 289 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  26.85 
 
 		 268 aa  49.3  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  27.84 
 
 		 287 aa  49.3  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2175  heat shock protein HtpX  23.3 
 
 		 293 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000524966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3844  heat shock protein HtpX  26.46 
 
 		 295 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00537908  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2272  HtpX domain-containing protein  25.94 
 
 		 292 aa  48.9  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1051  HtpX domain protein  24.84 
 
 		 309 aa  49.3  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1568  heat shock protein HtpX  27.13 
 
 		 287 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 		 295 aa  48.9  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  23.71 
 
 		 307 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27480  heat shock protein HtpX  26.88 
 
 		 291 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.538581  normal  0.110611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2325  heat shock protein HtpX  26.88 
 
 		 291 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  23.51 
 
 		 309 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1446  heat shock protein HtpX  26.07 
 
 		 295 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.501086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1480  heat shock protein HtpX  26.46 
 
 		 295 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0635  heat shock protein HtpX  26.38 
 
 		 287 aa  47.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000279457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2728  heat shock protein HtpX  26.36 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  24.74 
 
 		 282 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0377  heat shock protein HtpX  26.53 
 
 		 295 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  26.74 
 
 		 283 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  25.37 
 
 		 283 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2351  heat shock protein HtpX  26.74 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133306  decreased coverage  0.000000000558904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2423  heat shock protein HtpX  26.74 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000296306  decreased coverage  0.000159702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1870  heat shock protein HtpX  27.76 
 
 		 286 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000398337  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  33.58 
 
 		 419 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2512  heat shock protein HtpX  26.36 
 
 		 287 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000804246  hitchhiker  0.00000000151109 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  24.6 
 
 		 320 aa  46.6  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  25.39 
 
 		 285 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1774  HtpX domain-containing protein  26.4 
 
 		 293 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  30.66 
 
 		 429 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00404  heat shock protein HtpX  25.08 
 
 		 292 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>