43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8783 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
398 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  30.69 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  31.66 
 
 
420 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  25.32 
 
 
510 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  26.6 
 
 
285 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  24.11 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  27.04 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  35.87 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00404  heat shock protein HtpX  25.91 
 
 
292 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 
503 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  26.7 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  26.36 
 
 
296 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  25.68 
 
 
285 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  32.35 
 
 
312 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  25.94 
 
 
522 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  26.97 
 
 
279 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  30.4 
 
 
293 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  35.56 
 
 
615 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  25 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  25.35 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15400  heat shock protein HtpX  22.78 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  23.44 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  28.48 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  29.65 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  24.49 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  30.27 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  27.23 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  24.79 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  25.54 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 
281 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  25.13 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  25.13 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  28.67 
 
 
286 aa  44.3  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1130  Zn-dependent protease with chaperone function  28.98 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000361886  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  26.27 
 
 
645 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  23.39 
 
 
294 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
282 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  27.27 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  28.33 
 
 
485 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  26.2 
 
 
623 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  26.35 
 
 
286 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>