65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4115 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  80 
 
 		 237 aa  363  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  79.28 
 
 		 223 aa  338  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  77.93 
 
 		 223 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  77.93 
 
 		 223 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  77.93 
 
 		 223 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  75.68 
 
 		 223 aa  328  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  75.68 
 
 		 223 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  76.58 
 
 		 223 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  78.97 
 
 		 224 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  69.68 
 
 		 224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  76.58 
 
 		 223 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  75.68 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  75.68 
 
 		 223 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.25 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.98 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.49 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 240 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.05 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.05 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 241 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.01 
 
 		 272 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  36.04 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.14 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.14 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.14 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.58 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.24 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.59 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.63 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.63 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.63 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.63 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.5 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.07 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  34.88 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  32.37 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  31.6 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  32.21 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  30.11 
 
 		 190 aa  92  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  33.16 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.39 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.06 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  29.3 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  33.33 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.11 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4645  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4646  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4265  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000728248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4626  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0609  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4253  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4630  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4755  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4414  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4346  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  25.12 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0730  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  22.64 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.545164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3217  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  23.58 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>