66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3961 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  99.1 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  99.1 
 
 		 223 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  98.65 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  95.07 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  95.07 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  95.07 
 
 		 223 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  92.83 
 
 		 223 aa  357  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  77.93 
 
 		 222 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  90.13 
 
 		 223 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  76.02 
 
 		 224 aa  345  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.35 
 
 		 237 aa  340  7e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  79.34 
 
 		 223 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.35 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  42.11 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.4 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.95 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.95 
 
 		 241 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.95 
 
 		 241 aa  161  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.48 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.48 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.27 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  37.69 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.61 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.61 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.61 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.26 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.68 
 
 		 241 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.68 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.48 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  42.25 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  34.74 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  32.52 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  33.33 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  31.73 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  33.52 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  36.21 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.73 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.16 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  28.71 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.19 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  30.27 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4645  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3217  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  25.66 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4646  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4414  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4630  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0609  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4626  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.181495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4755  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4253  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4265  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  24.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000728248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4346  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  25.33 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1206  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  21 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1228  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  21 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>