54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0507 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  100 
 
 
241 aa  487  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  84.65 
 
 
241 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  76.76 
 
 
241 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  80.89 
 
 
241 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  76.76 
 
 
241 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  80 
 
 
241 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  76.76 
 
 
241 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  75.83 
 
 
240 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  79.31 
 
 
234 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  79.56 
 
 
240 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  79.11 
 
 
240 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  79.11 
 
 
240 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  79.56 
 
 
240 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  68.33 
 
 
243 aa  322  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  61 
 
 
241 aa  321  8e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  60.17 
 
 
241 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  60.17 
 
 
241 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  60.17 
 
 
241 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  59.75 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  64.55 
 
 
247 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.28 
 
 
272 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  40.38 
 
 
237 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  41.4 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  40.49 
 
 
222 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  41.4 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  41.86 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  41.86 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  40.93 
 
 
223 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  40.93 
 
 
223 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  40.84 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.25 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.79 
 
 
258 aa  146  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.43 
 
 
260 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.43 
 
 
260 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.43 
 
 
260 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  37.62 
 
 
224 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  41.86 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  40.85 
 
 
224 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  40 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  40.47 
 
 
223 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  40.09 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.84 
 
 
254 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  39.18 
 
 
233 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.97 
 
 
226 aa  113  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  30 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  36.18 
 
 
190 aa  92.8  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  27.14 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  28.23 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  31.32 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.64 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  29.95 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  26.44 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  28.82 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1863  succinate dehydrogenase (or fumarate reductase) cytochrome b subunit, b558 family  26.47 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>