53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0333 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  100 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  79.28 
 
 		 222 aa  357  9e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  76.5 
 
 		 237 aa  338  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  79.81 
 
 		 223 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  79.34 
 
 		 223 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  79.34 
 
 		 223 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  77.46 
 
 		 223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  77.46 
 
 		 223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  77.93 
 
 		 223 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  71.56 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  73.99 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  76.68 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  77.46 
 
 		 223 aa  294  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  78.87 
 
 		 223 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.98 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  42.93 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  35.71 
 
 		 260 aa  159  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.05 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.05 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.67 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.94 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.94 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.05 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.94 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.51 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.51 
 
 		 240 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.74 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.91 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.02 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.05 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.71 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.36 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.12 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.12 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.12 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.12 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.54 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  32.86 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.33 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.09 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.24 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.12 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  29.12 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  30.56 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  34.41 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  28.65 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  30.27 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>