64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3936 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  100 
 
 
223 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  99.1 
 
 
223 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  99.1 
 
 
223 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  94.17 
 
 
223 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  94.17 
 
 
223 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  97.76 
 
 
223 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  94.17 
 
 
223 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  92.83 
 
 
223 aa  357  8e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  77.93 
 
 
222 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  89.24 
 
 
223 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  76.02 
 
 
224 aa  345  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.35 
 
 
237 aa  340  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  79.81 
 
 
223 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.81 
 
 
224 aa  304  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  42.11 
 
 
234 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.4 
 
 
241 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 
241 aa  165  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.48 
 
 
247 aa  164  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 
240 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.95 
 
 
241 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 
240 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.48 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.43 
 
 
240 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.48 
 
 
240 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.27 
 
 
272 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 
241 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 
241 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 
241 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  37.69 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.61 
 
 
260 aa  154  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.61 
 
 
260 aa  154  9e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.61 
 
 
260 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.38 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.21 
 
 
241 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.81 
 
 
259 aa  148  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 
241 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.85 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.71 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  34.27 
 
 
221 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  32.52 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.86 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  31.25 
 
 
214 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  33.9 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  35.63 
 
 
215 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.73 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  31.66 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  28.22 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.19 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.84 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1734  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  25.54 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3217  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  25.22 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4645  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4646  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4626  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4630  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0609  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4755  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4414  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4253  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4265  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  24.34 
 
 
208 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000728248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>