54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0394 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  100 
 
 
260 aa  534  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  57.92 
 
 
260 aa  294  8e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  57.92 
 
 
260 aa  294  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  57.92 
 
 
260 aa  294  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  58.68 
 
 
258 aa  291  9e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  55.82 
 
 
259 aa  288  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  47.03 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  47.58 
 
 
254 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  38.84 
 
 
237 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  41.67 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.93 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.37 
 
 
241 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40 
 
 
240 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  35.71 
 
 
223 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.57 
 
 
240 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.57 
 
 
240 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  34.91 
 
 
222 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.37 
 
 
241 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.37 
 
 
241 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.37 
 
 
241 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.72 
 
 
241 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.15 
 
 
240 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.09 
 
 
241 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.89 
 
 
241 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.89 
 
 
241 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.89 
 
 
241 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.28 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  36.45 
 
 
223 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  36.45 
 
 
223 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  37.38 
 
 
223 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  37.38 
 
 
223 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  35.98 
 
 
223 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.79 
 
 
240 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  40.61 
 
 
226 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  38.68 
 
 
224 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  35.55 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.68 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.02 
 
 
241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  35.98 
 
 
223 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  37.38 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.65 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  36.92 
 
 
223 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  35.27 
 
 
223 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.05 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  37.17 
 
 
190 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.41 
 
 
218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  34.25 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  32.86 
 
 
221 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  30.65 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  29.11 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  28.84 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  28.28 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.42 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0730  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  23.21 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.545164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>