53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1530 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  46.34 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  39.41 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  42.13 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  34.52 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  33.87 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  36.42 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  32.26 
 
 		 260 aa  99  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  32.26 
 
 		 260 aa  99  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  32.26 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  27.01 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  27.65 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  28.64 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  30.62 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.2 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  27.31 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  25.59 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.3 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  29.3 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.54 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  27.01 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.54 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.07 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.52 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.54 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.07 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.07 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.39 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  26.79 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  28.36 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  25.12 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  27.88 
 
 		 241 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.92 
 
 		 237 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  25.96 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  25.96 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  25.96 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  25.96 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  30.27 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  28.06 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  32.57 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  31.19 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  33.72 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.84 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  27.19 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.84 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.21 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.21 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.84 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  25.82 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  27.91 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  29.21 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  30.23 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  30.81 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>