63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0508 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  100 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  80 
 
 		 222 aa  363  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  75.35 
 
 		 223 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  75.35 
 
 		 223 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  76.5 
 
 		 223 aa  321  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.35 
 
 		 223 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.35 
 
 		 223 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  73.36 
 
 		 224 aa  317  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  75.35 
 
 		 223 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  73.95 
 
 		 223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  74.77 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  74.88 
 
 		 223 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  73.95 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  74.42 
 
 		 223 aa  291  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.06 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.38 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.03 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.63 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.63 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.63 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.46 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.38 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.55 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.55 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  38.84 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.55 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.05 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.44 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.15 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  40.09 
 
 		 272 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.26 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.56 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.93 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.68 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.68 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  41.49 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.68 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.68 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  36.07 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  35.27 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  35.41 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.06 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  31.71 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  31.72 
 
 		 190 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  30.69 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  32.28 
 
 		 216 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  30.86 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  31 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.92 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  29.26 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4645  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.06 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4646  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  24.06 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4626  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.181495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0609  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4265  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000728248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4414  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4630  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4253  succinate dehydrogenase cytochrome B-558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4755  succinate dehydrogenase, cytochrome b558 subunit  23.58 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4346  succinate dehydrogenase/fumarate reductase cytochrome b subunit  24.19 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>