53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2204 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2204  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  100 
 
 
233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.715653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0426  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  77.37 
 
 
190 aa  296  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.723989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0856  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  57.51 
 
 
226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.544237  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0333  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  45.85 
 
 
259 aa  190  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0416  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  45.85 
 
 
258 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.335432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0432  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  45.45 
 
 
260 aa  185  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.909702  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1549  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  45.45 
 
 
260 aa  185  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0457  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  45.45 
 
 
260 aa  185  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1778  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  42.59 
 
 
272 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0394  Fumarate reductase respiratory complex  42.65 
 
 
260 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000835406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3441  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.92 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.208982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0332  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.51 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475162  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3623  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  43.53 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0392  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.3 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0402  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  43.53 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0401  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  43.53 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4116  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.43 
 
 
241 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000750156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0396  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.22 
 
 
241 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0507  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.18 
 
 
241 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572796  hitchhiker  0.00276017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3937  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.42 
 
 
240 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4078  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.42 
 
 
240 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.278058  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3885  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  38.42 
 
 
240 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3962  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  37.93 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.197693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0680  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.06 
 
 
241 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0508  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  35.27 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3749  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  35.61 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0638  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.07 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0616  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.07 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0643  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  34.07 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4115  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  32.37 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0456  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  33.66 
 
 
247 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1492  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  39.49 
 
 
254 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3884  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  33.01 
 
 
223 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0403  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.5 
 
 
223 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76044  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0402  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.5 
 
 
223 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3961  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  32.52 
 
 
223 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3936  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  32.52 
 
 
223 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0333  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.33 
 
 
223 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.926727  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4077  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  32.04 
 
 
223 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2000  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  32.71 
 
 
221 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000135298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3222  fumarate reductase cytochrome b-556 subunit  42.35 
 
 
243 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3066  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  32.55 
 
 
214 aa  98.6  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3622  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  33.01 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468172  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0393  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  33.82 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3221  fumarate reductase cytochrome B subunit  30.81 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3440  fumarate reductase respiratory complex, transmembrane subunit  31.31 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0397  fumarate reductase cytochrome B subunit  32.04 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1258  fumarate reductase, cytochrome b subunit  30.14 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1530  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  29.52 
 
 
209 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.174054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0128  fumarate reductase, cytochrome b subunit  29.65 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459466  normal  0.0844683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1065  Fumarate reductase respiratory complex  28.14 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.494955  normal  0.0281879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1929  fumarate reductase, cytochrome b subunit  27.16 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2458  fumarate reductase respiratory complex transmembrane subunit  28.92 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>