More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5743 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5743  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  952    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.83 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  48.42 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.42 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  48.42 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.42 
 
 		 482 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.21 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.42 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  51.05 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.02 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.42 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.21 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.7 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.21 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  51.48 
 
 		 491 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.85 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.58 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.57 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0598  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 492 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2003  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.5 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000861925 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48 
 
 		 483 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 484 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.89 
 
 		 488 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.93 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.3 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  51.05 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.3 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.3 
 
 		 480 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2189  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.51 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.56 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 489 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.68 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.26 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.52 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.47 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.32 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 492 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.17 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.3 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.35 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.8 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1778  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.38 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.45 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0062  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2917  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6109  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.949426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4998  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.27 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.38 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4701  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.11 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.89 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46.71 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46.5 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.01 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  46.71 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  46.71 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  46.71 
 
 		 483 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.49 
 
 		 479 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.13 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3067  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.97 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0865866  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>