39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4949 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  100 
 
 		 107 aa  213  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  42 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  41.18 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  37.38 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  46.59 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  47.13 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  44.32 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  49.44 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  47.78 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  43.69 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  45.45 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  41.3 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  41.3 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  41.3 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  38.3 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  46.53 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  44.19 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  46.25 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  40.45 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  40.22 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  40.4 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  35.58 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  35.29 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  43.06 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  33.73 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  34.02 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  36.99 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  32.91 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  28.89 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  36.23 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  32.58 
 
 		 102 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  32.58 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  32.58 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  32.63 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  34.72 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  36.76 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  31.76 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>