39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2341 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  239  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  76.61 
 
 
127 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  65.32 
 
 
126 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  69.23 
 
 
126 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  69.23 
 
 
126 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  48.54 
 
 
124 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  42.61 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  46.39 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  49.51 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  47.42 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  39.81 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  43.62 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  41.49 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  47.78 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  40.82 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  40.37 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  43.59 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  40 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  38.82 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  41.76 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  42.05 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  38.2 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  38.38 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  29.91 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  34.88 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  31.13 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  29.55 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  30.19 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  38.89 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  43.04 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  32.95 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  26.97 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  26.58 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>