59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2549 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  209  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  61.39 
 
 
101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  66.02 
 
 
103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  51.52 
 
 
108 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  51.58 
 
 
99 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  46.32 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  41 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  42.11 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  44.32 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  40.66 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  45.16 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  35.56 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  36.17 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  40.96 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  35 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  39.56 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  38.55 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  40.66 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  29.07 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  37.23 
 
 
97 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  24.76 
 
 
145 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  27.06 
 
 
102 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  27.91 
 
 
111 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  31.4 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  37.78 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  28.74 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  34.72 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  25.77 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  29.89 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  27.63 
 
 
102 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  34.07 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  27.45 
 
 
143 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  27.63 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  27.63 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  35.23 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  25 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  24.68 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  32.95 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  25.69 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  32.1 
 
 
156 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  24.18 
 
 
105 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  32.14 
 
 
140 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  24.18 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  28.12 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  30.77 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  34.09 
 
 
124 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>