28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  239  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  52.94 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  54.88 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  51.4 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  51.02 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  53.12 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  49.46 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  51.55 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  50.96 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  47.13 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  44.44 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  42 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  42.27 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  43.01 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  43.01 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  43.01 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  42.72 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  48.35 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  43.96 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  39.08 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  38.37 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  35.23 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  32 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>