35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1596 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  240  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  70.34 
 
 
120 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  46.53 
 
 
124 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  49.06 
 
 
168 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  45.54 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  41.75 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  41.23 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  39.45 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  46.59 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  45.88 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  45.56 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  48.48 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  38.83 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  41.67 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  37.86 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  45.16 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  36.11 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  40.4 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  34.62 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  34.29 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  37.63 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  36.05 
 
 
107 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  32.61 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  38.71 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  31.46 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  32.32 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  27.1 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  30.63 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  27.91 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  29.03 
 
 
105 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  31.19 
 
 
111 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>