57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1951 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  100 
 
 		 119 aa  235  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  51.52 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  48.98 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  42.45 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  44.76 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  40.91 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  42.39 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  44.79 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  40.68 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  41.12 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  41.12 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  45 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  44.44 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  44.86 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  38.3 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  39.18 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  46.67 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  38.46 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  45.71 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  39.13 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  39.13 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  32.67 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  31.13 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  32.91 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  34.09 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  36.84 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  35.62 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  39.74 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  35.96 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  32.04 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  32.04 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  25.81 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  29.9 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  23.66 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  29.63 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  34.52 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  23.4 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  32.65 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  30.11 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2670  hypothetical protein  25.77 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  30.59 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  26.32 
 
 		 127 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.076779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>