34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2129 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  227  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  38.89 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  40.59 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  41.11 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  33.7 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  40.66 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  39.56 
 
 
97 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  39.56 
 
 
97 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  31.86 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  38.04 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  33 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  31.13 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  35.44 
 
 
97 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  31.4 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  41.57 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  33.7 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  34.48 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  32.58 
 
 
148 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  32.1 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  31.03 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  31.87 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  37.04 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  29.67 
 
 
108 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  28.41 
 
 
140 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>