62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5176 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  55.93 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  55.1 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  46.25 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  43.59 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  35.14 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  39.08 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  39.58 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  38.37 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  41.25 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  41.25 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  41.25 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  39.08 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  37.65 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  36.78 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  48.19 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  45.12 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  34 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  33.94 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  36.92 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  40.54 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  43.9 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  43.9 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  43.9 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  38.82 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  32.91 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  38.82 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  31.03 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  34.15 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  36.46 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  28.41 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  32.86 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  35.8 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  38.37 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  31.78 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  31.11 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  34.67 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  41.46 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  27.17 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  28.41 
 
 		 111 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 102 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  40.51 
 
 		 168 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  32.14 
 
 		 103 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  34.52 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  40.82 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  41.86 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  33.8 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>