71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3578 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  219  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  92.79 
 
 
111 aa  203  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  53.98 
 
 
140 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  56.99 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  52.88 
 
 
105 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  48.08 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  46.24 
 
 
102 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  50.91 
 
 
127 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  51.61 
 
 
123 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  48.57 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  49.45 
 
 
114 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  45.83 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  47.25 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  42.39 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  44.64 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  35.45 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  35.65 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  43.96 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  40.57 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  38.3 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  37.89 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  38.78 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  34.74 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  30.65 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  43.48 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  31.25 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  32.95 
 
 
101 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  30.47 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  34.65 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  24.42 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  27.91 
 
 
103 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  32.61 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  30.34 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  30.85 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  25.81 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  36.54 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  30.19 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  33.71 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  32.86 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  30.85 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  32.91 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  27.59 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  43.9  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  32.41 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  29.59 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  35.21 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  41.51 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  34.78 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  29.89 
 
 
113 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  28.36 
 
 
103 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  27.47 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  26.37 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  26.37 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  34.72 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>