31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5237 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  51.04 
 
 		 124 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  56.1 
 
 		 148 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  48.89 
 
 		 107 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  54.88 
 
 		 124 aa  88.6  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  52.44 
 
 		 111 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  45.88 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  47.83 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  41.94 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  45.35 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  43.21 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  44.44 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  48.81 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  49.4 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  43.42 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  43.42 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  43.42 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  43.9 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  42.7 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  38.27 
 
 		 116 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  36.08 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  36.63 
 
 		 117 aa  44.7  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  32.58 
 
 		 100 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  32.5 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  28.41 
 
 		 89 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  31.08 
 
 		 104 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  33.72 
 
 		 99 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>