23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37260  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  259  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2390  hypothetical protein  56.44 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0727974  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28530  hypothetical protein  46.22 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1602  hypothetical protein  46.22 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2278  inner membrane protein  53.19 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4864  export protein  56.44 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.917726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4331  membrane protein  52.87 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  45.69 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  49.4 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  48.45 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1596  hypothetical protein  42.42 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000114337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24600  hypothetical protein  54.46 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  43.68 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4949  putative transmembrane protein  40.82 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  41 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  43.53 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  43.53 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4315  membrane protein  45.71 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25101  normal  0.607274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1266  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.390774  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17180  hypothetical protein  40.4 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03630  hypothetical protein  43.3 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4304  hypothetical protein  43.81 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.617821  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>